أن تكون داراً للعلم والتعلم تعمل على تحصيله وتدريسه وتطوير مناهجه وتعمل على جعل القرآن الكريم محوراً للعلم والحياة ، تقوم بتدريسه وتدريس علومه ، وعلوم اللغة العربية ، وذلك لتساهم المساهمة الفاعلة في ترشيد حركة المجتمع وتثقيفه الديني، ورفع مستواه وإثراء حياة الأمة السودانية بمقومات الإسلام .
الأهداف
إعداد متخصصين في الدراسات القرآنية وما يتصل بها من علوم.
تأهيل متخصصين في الدراسات الإسلامية (العقيدة ، التفسير ، الحديث). مزودين بقدر وافر من المعرفة بالقرآن الكريم حفظاً وتجويداً.
الإسهام في رفع قدرات حفظة القرآن الكريم وتأهيلهم في مجال القراءات والدراسات الإسلامية .
الإسهام في إعداد البحوث والدراسات ، ودعم ما يتصل منها بقضايا تأصيل العلوم في المجالات الأخرى .
تحقيق أهداف الجامعة والتي تتمثل في الآتي :
إعداد الكوادر المؤهلة للإسهام في حركة دفع المجتمع لربط قيم السماء بقواقع الأرض. وتحقيق ذات الإنسان من خلال أهداف الأمة التي ينتمي إلبها , والتطور والتقدم على أساس روحي وأخلاقي .
الانفتاح على المجتمع وذلك من خلال الدورات التي تعدها الكلية لإعداد الدعاة ، وتدريب شرائح مختلفة من المجتمع.
تقديم دراسات إضافية في التجويد والدّراسات الإسلامية وتشجيع البحوث العلمية.
* خطّتها الاستراتيجية رؤى متقدمة وإضافات جديدة للأقسام (تعليم القرآن الكريم ، والتفسير ، والحديث، والعقيدة ، والسيرة ) .
كلية القرآن الكريم تعتبر أمَّ الكليات بالجامعة. أُنشأت في العام الدراسي 1425هـ الموافق 2004م، و تقوم بتطوير وسائل التعليم ، وتخريج طلاب حافظين لكتاب الله .